センター規則の目的の条には、「センターは，世界最高水準の国際的研究教育拠点として，エネルギー資源枯渇問題や地球環境問題を解決して世界の持続的発展を支えるため，広く社会に受け入れられる原子力システムの概念構築とそれに必要な基盤研究を行い，もって，原子力研究分野のより一層の発展を図ることを目的とする。」と定められている。

　本センターはCOE-INES拠点リーダーがセンター長として学長より任命され、センターの業務を総括している。センターは6名の主要メンバーを含む22名の構成メンバーからなっている。これらメンバーのいずれもがCOE-INESメンバーとなっている。この他にCOE-INES以外の東工大の3名の教官に協力メンバーとして参加してもらっている。更に小型炉の研究開発を促進するため、CRINES特任教授を招聘する。なお特任教授に係わる人件費等はCOE-INESとは別会計で行う。